HỦY HỒ SƠ HOÀN THUẾ GTGT

HỦY HỒ SƠ HOÀN THUẾ GTGT VÀ CHUYỂN SANG KHẤU TRỪ.

Trong quá trình kê khai thuế GTGT, doanh nghiệp có thể phát sinh trường hợp đã nộp hồ sơ đề nghị hoàn thuế nhưng sau đó có nhu cầu hủy hồ sơ hoàn và chuyển số thuế GTGT sang khấu trừ vào các kỳ tiếp theo.

Từ ngày 01/07/2026, trường hợp này được hướng dẫn tại Điều 47 và Phụ lục II Thông tư 89/2026/TT-BTC.

1. Khi nào doanh nghiệp được hủy hồ sơ hoàn thuế?

Theo quy định, người nộp thuế được đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế nếu:

• Cơ quan thuế chưa ban hành Quyết định hoàn thuế đối với hồ sơ thuộc diện hoàn trước; hoặc
• Cơ quan thuế chưa công bố Quyết định kiểm tra đối với hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước hoàn thuế.

Để thực hiện hủy hồ sơ, doanh nghiệp gửi Văn bản đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế theo Mẫu số 01/ĐNHUY ban hành kèm theo Thông tư 89/2026/TT-BTC.

Sau khi cơ quan thuế tiếp nhận văn bản đề nghị hủy, hồ sơ hoàn thuế được kết thúc giải quyết trên hệ thống theo quy định.

2. Số thuế đã đề nghị hoàn được chuyển sang khấu trừ như thế nào?

Một điểm đáng lưu ý là không có quy định Doanh nghiệp được nộp lại hồ sơ hoàn sau khi thủ tục hủy hồ sơ hoàn thuế được chấp nhận.

Theo hướng dẫn tại Thông tư 89/2026/TT-BTC, sau khi nhận được Thông báo về việc tiếp nhận Văn bản đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế, doanh nghiệp thực hiện khai bổ sung hồ sơ khai thuế để điều chỉnh số thuế đã đề nghị hoàn.

Trường hợp số thuế này đáp ứng đầy đủ điều kiện khấu trừ theo quy định về thuế GTGT, doanh nghiệp được chuyển số thuế sang khấu trừ vào kỳ tiếp theo.

Cụ thể, doanh nghiệp thực hiện:

Bước 1: Gửi Văn bản đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế theo Mẫu số 01/ĐNHUY.

Bước 2: Sau khi nhận được thông báo tiếp nhận của cơ quan thuế, doanh nghiệp thực hiện khai bổ sung hồ sơ khai thuế của kỳ có số thuế đã đề nghị hoàn để điều chỉnh giảm số thuế đề nghị hoàn.

Bước 3: Số thuế GTGT sau khi điều chỉnh, nếu đủ điều kiện khấu trừ, được kê khai vào chỉ tiêu “Điều chỉnh tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai thuế GTGT của kỳ hiện tại.

3. Ví dụ minh họa

Doanh nghiệp có số thuế GTGT còn được khấu trừ của kỳ tháng 06/2026 là 5 tỷ đồng, trong đó đã lập hồ sơ đề nghị hoàn 3 tỷ đồng.

Tuy nhiên, doanh nghiệp sau đó quyết định không thực hiện hoàn thuế mà muốn tiếp tục khấu trừ số thuế này vào các kỳ sau.

Nếu cơ quan thuế chưa ban hành Quyết định hoàn thuế hoặc chưa công bố Quyết định kiểm tra trước hoàn thuế, doanh nghiệp có thể thực hiện:

• Gửi Mẫu 01/ĐNHUY đề nghị hủy hồ sơ hoàn thuế;
• Sau khi nhận được thông báo tiếp nhận, khai bổ sung tờ khai tháng 06/2026 để điều chỉnh giảm số thuế đề nghị hoàn 3 tỷ đồng;
• Kê khai 3 tỷ đồng đủ điều kiện khấu trừ vào chỉ tiêu “Điều chỉnh tăng số thuế GTGT còn được khấu trừ của các kỳ trước” trên tờ khai của kỳ hiện tại.

Như vậy, số thuế GTGT này không bị mất quyền khấu trừ mà được chuyển từ số thuế đề nghị hoàn sang số thuế GTGT còn được khấu trừ của doanh nghiệp.

4. Một số lưu ý đối với doanh nghiệp

Doanh nghiệp cần đặc biệt lưu ý thời điểm thực hiện hủy hồ sơ hoàn thuế. Nếu cơ quan thuế đã ban hành Quyết định hoàn thuế hoặc đã công bố Quyết định kiểm tra đối với hồ sơ thuộc diện kiểm tra trước hoàn thuế thì việc hủy hồ sơ không còn được thực hiện theo cơ chế nêu trên.

Ngoài ra, số thuế GTGT chuyển sang khấu trừ phải đáp ứng đầy đủ điều kiện khấu trừ thuế GTGT theo quy định pháp luật. Do đó, doanh nghiệp cần kiểm tra chứng từ, hóa đơn, thanh toán không dùng tiền mặt và các điều kiện liên quan trước khi đưa số thuế này vào khấu trừ.